2026年5月29日,云南大学生命科学学院于黎/王晓萍课题组自主研发的两项软件成果“ChatCellAnno”和“DistantSV‑Cross”,顺利通过中华人民共和国国家版权局审核,正式获得计算机软件著作权登记证书。两项软件著作权由于黎研究员、王晓萍副研究员,以及博士研究生赵昊哲、汪亚军共同完成。
ChatCellAnno:基于大语言模型的单细胞注释软件
著作权人:于黎、赵昊哲、王晓萍

ChatCellAnno 是一款桌面端软件,将大语言模型引入单细胞测序数据的细胞类型注释流程。软件支持 marker 基因结果文件导入,可对数据进行自动识别与标准化整理,并根据组织来源、物种背景等信息生成注释提示,辅助用户判断细胞类型。同时,软件可整合富集分析结果作为补充证据,并将注释结论整理为结构化的“cluster—细胞类型—依据说明”格式。为方便后续分析,ChatCellAnno 还支持导出 Scanpy 和 Seurat 的可执行注释代码。软件基于 Python 3.10 与 PySide6 开发,源程序量 3674 行,可在 Windows、macOS 和 Linux 系统上运行。
DistantSV-Cross:一种用于检测远缘物种间基因组结构变异的系统
著作权人:于黎、汪亚军、王晓萍

DistantSV-Cross 是一套用于检测远缘物种间基因组结构变异的自动化分析流程。系统从基因组数据预处理开始,依次进行成对基因组比对、多序列比对整合、比对质量优化,最终检测目标物种特有的插入、缺失、倒位、染色体内易位和染色体间易位等结构变异,并通过计算断点侧翼序列的平均一致性来增强结果的可信度。该软件主要针对远缘物种基因组序列差异大、同源性识别困难等问题设计,用户只需提供组装好的基因组序列即可运行分析。软件基于 Python 3.8+ 开发,核心源程序量 2184 行,在 Linux 系统上运行。
两项软件的开发工作均在于黎研究员和王晓萍副研究员的指导下进行,博士研究生赵昊哲、汪亚军分别完成了 ChatCellAnno 和 DistantSV-Cross 的主要编程与测试工作。
致谢:感谢云南省科技领军人才项目、国家自然科学基金重点项目,国家自然科学基金地区项目等经费资助。